Eurajoessa on yhteensä 11 koskea, joissa kolmessa on voimalaitos. Eurajoki on aikanaan ollut merkittävä lohikalavesistö, ja joesta on vielä 1920-luvulla kalastettu lohta. Eurajoessa on toteutettu 2000-luvulla laajalti kalataloudellisia kunnostustoimia vaeltavien lohikalakantojen palauttamiseksi. Pappilankosken voimalaitospatoon ja Panelian säännöstelypatoon valmistuneiden kalateiden myötä kaloilla on nykyään vaellusmahdollisuus mereltä Kiukaisten keskustataajamassa sijaitsevalle Eurakosken voimalaitospadolle asti.